Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HOXD8P13378 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 SYCE3-201ENST00000402753 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HOXD8P13378 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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