Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL022313.2-201ENST00000442579 372 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PTPRT-212ENST00000620410 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCDH10Q9P2E7 SMIM30-201ENST00000397764 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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