Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BAG5-203ENST00000445922 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 KIAA0368-202ENST00000338205 7078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC26A2-201ENST00000286298 8080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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