Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NICN1Q9BSH3 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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