Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATP2A3Q93084 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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