Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CUL4BQ13620 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms