Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AP3M2P53677 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms