Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 IGLV2-33-201ENST00000390302 412 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC011389.2-201ENST00000514811 365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC004923.4-201ENST00000532296 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLD1P28340 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms