Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EXOC7-207ENST00000411744 2031 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA5-203ENST00000429027 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP1G1-218ENST00000569748 4554 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DHODH-205ENST00000572887 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL031714.1-201ENST00000567829 2926 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATP8B3-202ENST00000525591 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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