Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COG3Q96JB2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms