Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL035250.2-201ENST00000440889 620 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KCNK16-202ENST00000373229 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PPM1N-204ENST00000401593 548 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC009237.11-201ENST00000425635 265 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC018892.1-201ENST00000451098 265 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL139022.1-202ENST00000553633 796 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LINC01515-201ENST00000433152 1339 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC110753.1-201ENST00000505711 1022 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ARL15-205ENST00000507646 578 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC091965.1-201ENST00000512406 440 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PAX5-209ENST00000520154 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 USP2-AS1-203ENST00000530002 764 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC091544.2-201ENST00000555864 414 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MIR6750-201ENST00000617817 75 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 AC008993.1-201ENST00000632280 776 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
FAM208BQ5VWN6 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms