Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CALD1Q05682 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms