Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNB3P54284 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNB3P54284 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms