Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMTNP53814 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMTNP53814 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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