Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
POLD1P28340 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
POLD1P28340 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms