Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP35Q9P2H5 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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