Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
POLR2J2Q9GZM3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms