Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms