Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCOF1Q13428 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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