Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HERVK_113P63121 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms