Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms