Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CDK8P49336 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK8P49336 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK8P49336 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK8P49336 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK8P49336 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK8P49336 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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