Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GGCXP38435 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GGCXP38435 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms