Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTGS1P23219 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTGS1P23219 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms