Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PCNAP12004 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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PCNAP12004 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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