Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PF4P02776 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PF4P02776 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL359649.1-201ENST00000607406 1741 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PF4P02776 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PF4P02776 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PF4P02776 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC025268.1-201ENST00000632192 1199 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PF4P02776 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PF4P02776 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PF4P02776 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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