Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNASE1L3-207ENST00000486455 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC046143.1-201ENST00000447139 972 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf158-201ENST00000376210 695 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP9-10P-201ENST00000435672 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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