Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CRACR2AQ9BSW2 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms