Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RN7SL617P-201ENST00000485298 308 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MEG3-223ENST00000524131 721 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TNNT3-216ENST00000641119 941 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 NCR1-205ENST00000594765 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 EHMT1-210ENST00000478940 591 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC239859.4-201ENST00000582255 675 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC100830.3-201ENST00000583044 554 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL157392.3-218ENST00000600249 773 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 MDP1-201ENST00000288087 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 DBI-202ENST00000355857 637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL121892.1-201ENST00000422574 833 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KRT19P3-201ENST00000507547 828 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 CCDC148-203ENST00000409889 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC006022.1-201ENST00000425261 388 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 TXNDC9-205ENST00000434323 733 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM208BQ5VWN6 LSP1P3-201ENST00000449530 208 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms