Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
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TCOF1Q13428 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TCOF1Q13428 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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TCOF1Q13428 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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TCOF1Q13428 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCOF1Q13428 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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