Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 BOC-215ENST00000495514 4646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RAB4AP20338 MED29-207ENST00000615911 3565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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RAB4AP20338 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RAB4AP20338 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RAB4AP20338 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RAB4AP20338 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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RAB4AP20338 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RAB4AP20338 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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