Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 NAP1L6-201ENST00000373518 2044 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
VPREB1P12018 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms