Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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HOXA3O43365 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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