Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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USP35Q9P2H5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP35Q9P2H5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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