Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BDNF-215ENST00000530861 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MGLL-205ENST00000453507 4552 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM3Q9BZL3 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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