Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COG3Q96JB2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COG3Q96JB2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms