Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CFAP100Q494V2 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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