Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
RPS29P62273 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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