Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TMEM225BP0DP42 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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