Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX11Q9Y6N1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COX11Q9Y6N1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms