Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDY1Q9Y6F8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDY1Q9Y6F8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms