Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR2E3Q9Y5X4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NR2E3Q9Y5X4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2E3Q9Y5X4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms