Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAD54L2Q9Y4B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.7■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
RAD54L2Q9Y4B4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
RAD54L2Q9Y4B4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms