Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF3AQ9Y496 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms