Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAB1Q9Y478 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms