Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HCN4Q9Y3Q4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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HCN4Q9Y3Q4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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HCN4Q9Y3Q4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HCN4Q9Y3Q4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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