Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HDGFL3Q9Y3E1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HDGFL3Q9Y3E1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms