Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLF13Q9Y2Y9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLF13Q9Y2Y9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF13Q9Y2Y9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms