Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GIT1Q9Y2X7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GIT1Q9Y2X7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIT1Q9Y2X7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms