Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAN1Q9Y2M0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms